神灵丸有什么作用？
《水星领航员》中的“神灵丸”，实际上是由水母所释放出的微小水母所组成的团状结构，这些微小水母本身并无意识，但它们会自然游动，并受声音与色彩的刺激而发生变化和运动。 动画中提到的“使水星转动的神灵”指的就是由无数微小水母通过聚集、排列等相互之间的协作来产生出像地球自转与公转一样的“行星运转”，从而让水星上的人类得以生存下去，事实上就是这些肉眼无法看到的微小水母在“驱动”着水星（的旋转)。
神灵丸的颜色根据不同的情形会有不同的变化，当它感到“喜悦”(如阿丽斯说“我喜欢你”)时，它的颜色会变得亮丽起来；相反，若它感到“悲伤”(如奈津惠去世）或“愤怒”(如加地清次郎说“我要杀了你！")的时候，它的色彩就会黯淡下来。
可以说，神灵丸的这种特性就被类比成了人类的感情和情绪——人类自身是无法直接感受到这种来自微观世界的细微变化，但是可以间接地被类似水母这种低等生物的身体语言所代替(因为人类自身的语言是建立在类似神灵丸这样具有视觉能力的物种的基础之上)。人类对水星上的其他生物来说，就具有了“说话”的能力。